Faccio pubblica ammenda..."devo ricordarmi di cercare in maniera APPROFONDITA sul forum perchè li troverò le mie risposte" 
bravo

Ho trovato questo http://forums.contribs.org/index.php/topic,39935.0.html che descive esattamente la situazione in cui mi trovo io.
Da quel che capisco dovrei fare così:
- installare sme sul disco singolo
esatto.. per completezza, ricordati che anche con un solo hd SME verrà installato con un raid1 "mozzato" e con LVM
- collegare i due dischi sata
- montarli e configurare un raid tra i due (questo passaggio non mi è chirissimo, dovrò un po' studiare)
allora..
partizioni gli hd, metti il tipo (opzione T di fdisk) di partizione a fd (linux raid autodetect), crei l'array.. poi lo formatti in ext3
- aggiungere manualmente la condivisione sul file di configurazione di samba
questa non l'ho capita.. io monterei provvisoriamente l'array in /mnt/test, copierei tutta la /home con
copy -a /home/* /mnt/test/*
smonterei da /mnt/test, modificherei /etc/fstab in modo che l'array (/dev/md2 o 3) venga montato in /home
da provare prima su una macchina virtuale.. soprattutto verificare che il riavvio sia ok e che tutto sia a posto
Ciao
Stefano