Ok, adesso mi è più chiaro...
Quello che posso dirti è che nelle mie installazioni di SME 8 la directory /tmp ha dimensioni di poche centinaia di kilobyte e, se non ricordo male, è una di quelle cartelle che NON viene backuppata con la procedura di backup di SME.
Se backupassistant non ripulisce le "tracce" del suo "passaggio" non penso sia un problema di SME, forse quei dati della directory tmp vengono usati più volte e per questo rimangono lì, non conosco il programma quindi non posso esserti di maggiore aiuto.
Ma una domanda mi sorge spontanea... perchè vuoi fare pulizia in /tmp?
edit: si, /etc/cron.daily/tmpwatch fa una pulizia dei vecchi file...