Soweit ich weiß kann man beim SME7 im Server Manager nur Disk Quota einstellen, also die Größe die der User insgesamt an Speicherplatz hat, Webverzeichnis, Mail usw.
Über ein Template in entpsrechenden customer-templates Verzeichnis müßte es aber auch möglich sein die maximale Mailboxgröße alleine einzustellen, leider kann ich nicht sagen welche Werte genau gesetzt werden müßen.