ich würde es lassen, Daten raus kopieren und hinterher versuche machen irgendwelche Daten zu löschen.
Wenn das Dateisystem ne Macke weg hat, kann es durch löschen irgendwelcher Verzeichnisse auch zu Datenverlust in anderen kommen.
Hol erst die Daten sauber von der Platte, danach würde ich experimente machen.
mach mal "smartctl -a /dev/deinenPlatte" als hda, sda, was auch immer und poste mal alles komplett hier rein.
Mfg Igi