ahem....
il messaggio che ricevi dice infatti che quella versione del php/quel pacchetto adesso è necessario.. ma php-domxml (che è di php 4.3.9) è espressamente richiesto da smeserver-support.
il messaggio di errore lo avrai sempre, eccezion fatta per gli aggiornamenti che non comprendono, come detto, smeserver-support e e-smith-horde
come ti ho già detto, devi scaricarti in locale gli rpm più recenti di quei due pacchetti (le versioni esatte le trovi nella mail che hai ricevuto questa notte con la lista degli aggiornamenti (1)) ed installarli con il comando di cui sopra
(1) perchè TU ricevi e leggi le email che il server ti manda, vero?